Центральный орган управления Министерства обороны РФ и основной орган оперативного управления Вооруженными Силами - Генеральный штаб Вооружённых Сил Российской Федерации. Организует оборону РФ, мобилизационную подготовку, координацию войск и спецподразделений.
Генеральный штаб Вооружённых Сил Российской Федерации выступает одним из центральных органов управления военными силами Министерства обороны страны. В список основных обязанностей Генерального штаба, зафиксированных в соответствующем решении Президента Российской Федерации, Верховного главнокомандующего, входит организация плановых оборонительных мероприятий, координация деятельности войск и специальных подразделений, ориентированных на оборону государства.
Начиная с 2004 года, посредством реформирования работы Министерства обороны страны, список функций Генерального штаба в существенной мере был снижен. Изменения административного характера повлекли за собой избавление данного органа от исполнения целого ряда избыточных и несвойственных ему задач хозяйственного направления.
Уже в 2008, военная реформа, проводимая на территории Российской Федерации, разделила функциональный ряд подразделения Министерства обороны на два направления. Так, первая ветвь стала нести ответственность за планирование строительства и применения Вооруженных сил, вторая – обеспечение, в т.ч. кадровое. Принятые меры позволили избавить Генеральный Штаб от несвойственных ему функций.
На сегодняшний день основными направлениями деятельности структуры являются: стратегическое планирование применения Вооруженных Сил страны, мобилизация и подготовка войск прямого подчинения, координирование деятельности Вооруженных сил и проведение мероприятия, направленных на поддержание боевой и мобилизационной подготовки.
Так же, на Генштаб РФ возлагается перевод военных сил в формат военного времени, организация разведывательных мероприятий, защита государственной тайны и проведение научно-исследовательских исследований в Вооруженных силах Российской Федерации.